根據(jù)巴勒斯坦和以色列達(dá)成的關(guān)于巴勒斯坦自治協(xié)議，巴民族權(quán)力機(jī)構(gòu)是一階段性、過渡性的自治機(jī)構(gòu)，主要負(fù)責(zé)管理巴自治區(qū)內(nèi)除外交、安全以外的所有民事。

    1993年9月，巴勒斯坦解放組織與以色列在華盛頓簽署了巴勒斯坦自治《原則宣言》，允許巴勒斯坦人先行在加沙－杰里科地區(qū)實行自治，巴最終地位的談判在1999年5月4日前解決。1994年5月4日，巴解組織執(zhí)委會主席阿拉法特和以色列總理拉賓在埃及首都開羅正式簽署關(guān)于實施加沙—杰里科自治原則宣言的最后協(xié)議。同年5月12日，以阿拉法特為主席的巴勒斯坦自治領(lǐng)導(dǎo)機(jī)構(gòu)成立，并首先在加沙和杰里科實行自治，隨后自治范圍擴(kuò)大到約旦河西岸。

    1994年5月26日，巴自治領(lǐng)導(dǎo)機(jī)構(gòu)在突尼斯舉行首次會議。會上通過了關(guān)于加沙和杰里科自治區(qū)臨時自治時期的政治綱領(lǐng)，重申了建立一個以耶路撒冷為首都的巴勒斯坦國的目標(biāo)。7月11日，阿拉法特結(jié)束了27年的流亡生活返回加沙定居后，巴勒斯坦自治領(lǐng)導(dǎo)機(jī)構(gòu)從突尼斯遷往加沙和杰里科。

    1996年1月20日，根據(jù)巴以關(guān)于擴(kuò)大巴勒斯坦在約旦河西岸自治協(xié)議的安排，巴勒斯坦舉行歷史上首次大選，選舉巴勒斯坦民族權(quán)力機(jī)構(gòu)（自治政府）主席和巴勒斯坦立法委員會。阿拉法特當(dāng)選為民族權(quán)力機(jī)構(gòu)（自治政府）主席。2月12日，阿拉法特正式宣誓就職。5月9日，阿拉法特組成自治政府內(nèi)閣。

    2001年12月初，由于巴一些激進(jìn)組織制造了一系列針對以色列目標(biāo)的襲擊事件，以色列把巴民族權(quán)力機(jī)構(gòu)定為“支持恐怖活動的實體”，并決定斷絕同阿拉法特的聯(lián)系，巴民族權(quán)力機(jī)構(gòu)處境十分艱難。為了推動巴以和談，去年3月，巴民族權(quán)力機(jī)構(gòu)進(jìn)行改革，設(shè)立了總理職位，阿巴斯當(dāng)選為首任總理。現(xiàn)任總理為庫賴。

    目前，巴民族權(quán)力機(jī)構(gòu)已經(jīng)在加沙地帶60％和約旦河西岸42．9％的土地上實行完全自治，巴控制的實際面積約2500平方公里。