新疆駐京辦事處的歷史最早可追溯到清朝光緒年間（1879年），哈密王府在北京建造了哈密會館，其位置在宣武門內(nèi)太平湖石駙馬胡同，共前后兩進院子，占地面積約十畝地。哈密館建成之后，除哈密王室成員赴京覲見時下榻之外，也為從新疆來北京的王公貴族、商人提供就宿，從特定意義上成為當(dāng)時的新疆政府駐北京辦事機構(gòu)。新中國成立之后，北京的哈密會館接管歸中央民族事務(wù)委員會管理，在解放初期起到過新疆駐京辦事處的作用。但是由于地方狹小，適應(yīng)不了新疆的發(fā)展需要，1955年經(jīng)國家批準(zhǔn)在北京市海淀區(qū)二里溝劃撥48畝地，建設(shè)成立了“新疆維吾爾自治區(qū)人民委員會駐北京辦事處”，這是全國各省市自治區(qū)最早在首都成立的辦事機構(gòu)之一。

      “文革”期間，鑒于當(dāng)時的混亂狀況，國務(wù)院于1966年12月向各省、市、自治區(qū)發(fā)出電報，決定撤銷駐京辦事處，新疆駐北京辦事處于1967年3月正式摘牌宣布撤銷?！八娜藥汀北淮虻购螅e國歡騰，祖國又迎來了新的春天。1978年4月自治區(qū)黨委任命林彬（楊勇司令員妻子）同志為首的新疆辦事處籌建領(lǐng)導(dǎo)班子，其任務(wù)是“將原來新疆駐京辦事處原址接受過來，然后組建辦事處”。同年8月新疆維吾爾自治區(qū)革命委員會向國務(wù)院辦公室、國家民族事務(wù)委員會呈報《關(guān)于設(shè)立新疆維吾爾自治區(qū)革命委員會駐北京辦事處的報告》，得到批準(zhǔn)，在改革開放的大好形勢下，開始了新疆駐北京辦事處的恢復(fù)工作。

      建筑面積36633平方米的一號樓，是1956年投資建成的一個L型坐西朝東的三層建筑。黃色的小樓點綴著伊斯蘭建筑特有的尖拱窗，頂部和周圍墻面配有新疆民間建筑紋飾圖案，其建筑風(fēng)格體現(xiàn)了濃郁的新疆民族特色風(fēng)格，成為京城里一道亮麗的景觀，現(xiàn)在它已被列為北京市有特色建筑物之一。1978年經(jīng)過李先念副主席，烏蘭夫副委員長和王震、谷牧等黨和國家領(lǐng)導(dǎo)人的批示確定將原新疆駐北京辦事處的院落和房產(chǎn)交還給新疆，1978年10月自治區(qū)與國管局正式進行了交接手續(xù)，接管后，新疆駐北京辦事處掛牌正式恢復(fù)辦公，當(dāng)時只有辦公室、接待科、行政科等三個科室和幾十張普通床位的招待所，領(lǐng)導(dǎo)干部和員工還不到四十幾個人。隨著改革開放的深入和有中國特色社會主義的建設(shè)，新疆駐北京辦事處不斷發(fā)展，現(xiàn)在已成為下設(shè)有辦公室、信息聯(lián)絡(luò)處、接待處、財務(wù)處、信訪勸返辦公室和工會等職能部門，有招待所、后勤服務(wù)中心、北戴河干部休養(yǎng)所等事業(yè)管理部門和對外經(jīng)營管理的新疆飯店、新疆大廈等高級酒店的廳局級派出駐京機構(gòu)。

      改革開放以來，辦事處在提供決策和政務(wù)聯(lián)絡(luò)，接待自治區(qū)領(lǐng)導(dǎo)和各族干部群眾，處理解決社會事務(wù)和維護首都社會穩(wěn)定等工作方面發(fā)揮了重大作用。同時，協(xié)助各地、州、市和有關(guān)部門在北京做了大量的招商引資、對外宣傳、聯(lián)系業(yè)務(wù)的工作，充分發(fā)揮了辦事處的“窗口”和“橋梁”作用。辦事處經(jīng)常代表自治區(qū)出席或參加國家有關(guān)部門的會議；經(jīng)常承辦自治區(qū)在北京舉辦的活動；代表新疆接受國內(nèi)外慈善機構(gòu)、紅十字會和國外駐華使館、商社團體捐贈的資金和物品；代表新疆人民政府和有關(guān)部門在京處理與新疆有關(guān)的問題。多年來，辦事處向自治區(qū)發(fā)送有關(guān)宏觀經(jīng)濟、市場調(diào)控、社會動態(tài)、理論前沿等各種信息，不僅為自治區(qū)黨政領(lǐng)導(dǎo)決策提供了重要的參考資料，而且為自治區(qū)的經(jīng)濟建設(shè)提供了有價值的資料。辦事處與國家各部、委，外國駐華使館和商社團體等機構(gòu)廣泛開展聯(lián)絡(luò)，為新疆有關(guān)部門地區(qū)牽線搭橋、招商引資，多年來，據(jù)不完全統(tǒng)計，直接聯(lián)系或間接參與促成的對內(nèi)對外合作的較大項目有幾十項。

      辦事處多次承接全國黨代會和全國人民代表大會等國家高級會議，接待“兩會”的議案組、民族語言文字翻譯組等重要的工作組；接待第十一屆亞運會觀摩團、第五屆世界婦女代表大會代表團等大型團體，受到有關(guān)領(lǐng)導(dǎo)和組織委員會的表揚。

      新疆獨特的自然資源和人文景觀一直為世人矚目，新疆駐京辦事處每年接待大量的國內(nèi)外各界人士，向他們宣傳新疆的經(jīng)濟和社會發(fā)展的形勢，介紹新疆的投資環(huán)境和投資項目，幫助聯(lián)系有關(guān)的業(yè)務(wù)，成為人們了解新疆、關(guān)注新疆的重要“窗口”。新疆濃郁的民族文化，獨特的旅游景點和豐富的資源項目，通過這個“窗口”為世人所了解，國內(nèi)外的先進技術(shù)、先進管理和先進理念通過新疆駐京辦傳送到自治區(qū)，成為現(xiàn)代溝通新疆與國內(nèi)外的“橋梁”。