清凈寺創(chuàng)建于北宋大中祥符2年(公元1009年),回歷400年。元至大二年(公元1309年)由伊朗艾哈默德重修。寺是仿照敘利亞大馬士革伊斯蘭教禮拜堂的形式建筑的。劇門樓北墻的阿拉伯碑刻記載,寺又名“艾蘇哈卜大寺”?,F(xiàn)存主要建筑有大門樓、奉天壇和明善堂。大門樓的外觀具有傳統(tǒng)的阿拉伯伊斯蘭教建筑形式。大門朝南,高12.3米,基寬6.60米,門寬3.80米,用輝綠巖條石砌筑,分外、中、內(nèi)三層。第一、二層皆為圓形穹頂拱門,第三層為磚砌圓頂。樓頂為平臺,四面環(huán)筑“回”字形垛子,有如城堞,北墻左右嵌有二方陰刻“月”、“臺”石刻,為伊斯蘭教徒“齋月”用以望月以便確定起齋日期,整座建筑造型巍峨壯觀。“奉天壇”是穆斯林禮拜的地方,現(xiàn)僅存四圍石墻。壇的屋蓋明代年間倒塌,殿內(nèi)四周的空地上尚存花崗巖的殘礎。入東墻尖拱形正門,看西墻正中有一法拱形的高大璧龕,龕內(nèi)刻有古阿拉伯文的《古蘭經(jīng)》經(jīng)名石刻,保存完好。寺的西北角為“明善堂”建于明隆慶元年(公元1567年),因奉天壇禮拜殿屋蓋倒塌后,教徒們便移此做禮拜。在門摟的東側(cè)“祝圣亭”內(nèi)立有元至正十年(公元1350年)、明萬歷三十七年(公元1609年)重修清凈寺的碑記,是研究泉州伊斯蘭教的重要物證。寺內(nèi)有明成祖于永樂五年(公元1407年)頒發(fā)保護清凈寺和伊斯蘭教的《敕諭》石刻一方,極為珍貴。
清凈寺是中國現(xiàn)存最古老的伊斯蘭教寺,在伊斯蘭世界也是有數(shù)的古寺之一。清凈寺是我國與阿拉伯各國人民友好往來和文化交流的歷史見證,也是泉州海外交通的重要史跡。