江蘇省鎮(zhèn)江市是我國伊斯蘭教傳人較早的地區(qū)之一，唐朝初年就有來自阿拉伯、波斯地區(qū)的商人前來貿(mào)易、經(jīng)商，并建有清真寺。明萬歷二十四年(1596年)《鎮(zhèn)江府志》記載：“清真禮拜寺系唐貞觀二年(628年)始建于仁安坊阜民街，明洪武間毀后再建。”宋元時期，在鎮(zhèn)江定居的穆斯林人口大增，米芾、薩都刺等一大批回族官員在此留下了清廉的政績和無數(shù)傳世書畫作品。到明朝時期，回族在鎮(zhèn)江已經(jīng)形成大分散小集中的態(tài)勢，穆斯林聚居區(qū)亦已形成。清朝末期到民國期間，鎮(zhèn)江回族經(jīng)濟(jì)發(fā)展迅速，壟斷了當(dāng)?shù)匚褰?、百貨、餐飲、珠寶等行業(yè)的大部分市場。

為了方便進(jìn)行宗教生活，生活在聚居區(qū)的鎮(zhèn)江穆斯林便集資修建清真寺，山巷清真寺即是其中之一。該寺西臨著名街道山巷，故得其名，又因地處古城西門外，亦稱城西清真寺、西大寺。據(jù)清光緒五年(1879年)《丹徒縣志》記載：山巷清真寺初建時僅有茅舍三間，“系康熙年間(1662一1722年)廓其基宇，咸豐三年  (1853年)毀于兵燹。同治十二年(1873年)重建”。后來，穆斯林群眾通過抽取“日兒錢”，聚沙成塔，終于在光緒二十八年(1902年)三月對山巷清真寺進(jìn)行了一次大規(guī)模擴(kuò)建，使之初具今日規(guī)模。

山巷清真寺占地近3畝，主體為中國宮殿式建筑風(fēng)格，主要建筑有門樓、前廳、天井、大殿、南講堂、對廳和望月樓。雕梁畫棟，結(jié)構(gòu)嚴(yán)謹(jǐn)，莊重典雅。

清真寺正門面對長方形照壁，坐東朝西。正門樓面闊三間，進(jìn)深兩間，綠色大門居中，一對漢白玉石鼓分立左右，斗拱復(fù)檐飾以水彩，門額高懸朱漆紅匾一塊，上書“清真寺”三個金字。寺內(nèi)“井”字形大天井的四角，栽有批把、銀杏、金桂和翠柏，四周繞以木質(zhì)花式回廊。天井西面是禮拜大殿，由窯殿、正殿、輔殿(備殿)與卷棚組成。其地基高于天井約60厘米，條石臺階被寓以宗教含義，三級臺階數(shù)目分別為五、二、七，分別代表“五大功修”、“兩世吉慶”、“七日聚禮”，可謂獨(dú)具匠心。大殿面闊五楹、進(jìn)深十四檁，硬山高脊，斗拱單檐，正面置20扇高大窗格花門，兩旁開有8扇門，便于通風(fēng)及緊急疏散。整個大殿共使用了直徑45厘米、高3.5-8米不等的圓木立柱52根。窯殿面闊7.4米，進(jìn)深5.2米，兩角挑出長檐，檐角翹起，兩旁有16扇格式明窗，當(dāng)中砌成“米哈拉布”(凹壁)，紅漆“敏拜爾”(宣講臺)置于右首。

山巷清真寺內(nèi)部部分結(jié)構(gòu)帶有明顯的阿拉伯建筑風(fēng)格，如禮拜大殿兩組拱形圓門。大殿橫梁及頂部的粉末水彩畫為南方所罕見，以山水、花草、樹木、瓜果和幾何圖形、云紋等作為裝飾圖案，計有千余幅，其中帶有米芾開創(chuàng)的“米家山水”畫風(fēng)的長方形山水畫多達(dá)40幅。此外，還有少見的八邊形瘦竹圖4幅，《古蘭經(jīng)》中提及的水果和蔬菜在此也有所體現(xiàn)。

歷史上，鎮(zhèn)江曾是中國伊斯蘭教金陵學(xué)派“以儒詮經(jīng)”的重要地區(qū)之一。明末清初，江南回族知識分子王岱輿、張中、劉智、伍遵契、趙燦等紛紛著書立說，他們用中國傳統(tǒng)的儒家思想來詮釋伊斯蘭經(jīng)典教義。當(dāng)時，伍遵契就任鎮(zhèn)江清真寺掌教。山巷清真寺充分發(fā)揮了經(jīng)濟(jì)獨(dú)立和運(yùn)輸便利的優(yōu)勢，木刻刊印過《寶命真經(jīng)》、《天方典禮》、《天方性禮》、《天方至圣實錄》、《大化總歸》等20多種伊斯蘭教哲學(xué)和教義書籍，通過水陸兩路，輸往全國各地。據(jù)中國伊協(xié)副會長、江蘇省伊協(xié)會長伍貽業(yè)考證：“鎮(zhèn)江在明清兩朝是伊斯蘭教文化出版事業(yè)中心，有許多穆斯林先賢的宗教著作就是在鎮(zhèn)江出版的，單是刻版少說也在數(shù)萬之上。”現(xiàn)北京民族文化宮、中央民族大學(xué)圖書館、北京大學(xué)圖書館等處均藏有該時期鎮(zhèn)江清真寺版本的書籍。

歷史上，山巷清真寺的經(jīng)堂教育也在國內(nèi)外享有盛名。山巷清真寺清真大學(xué)創(chuàng)辦于光緒二十九年(1903年)，當(dāng)時掌教楊正茲阿訇特聘河南王寶云經(jīng)師(王四阿訇)任首席講師，自己也授課，清真大學(xué)的“學(xué)院”門楣石刻現(xiàn)仍存于寺內(nèi)。1936年還創(chuàng)辦了《回報》，內(nèi)容有各地伊斯蘭教的動態(tài)、新聞和經(jīng)典、教義的研究。期間聘請過楊竹坪、劉振宇、劉金亮、李福真、買俊三、馬品三等著名經(jīng)師在此設(shè)帳講學(xué)。

抗戰(zhàn)期間，山巷清真寺成立了“西大寺避難所，收容各族難民”，“為被炸毀的穆源小學(xué)提供教學(xué)校舍長達(dá)20年之久(1938-1958年)”?？箲?zhàn)勝利后，山巷清真寺組織部分殷實富有的穆斯林企業(yè)家成立了回民敬恤會，對貧困穆斯林進(jìn)行扶貧；另外還辦起“回教施診所”，為各族貧病百姓送醫(yī)施藥、免費(fèi)治病。敬恤會奉行“扶貧濟(jì)困、團(tuán)結(jié)互助”的宗旨，一直延續(xù)至今。山巷清真寺董事會還組織具有相當(dāng)經(jīng)濟(jì)實力的回族商人聯(lián)合出資購買了南郊何家灣36畝山地作為回族公墓，這是鎮(zhèn)江有史以來第一塊真正意義上的回族公墓。

山巷清真寺一直秉承著傳承、研究伊斯蘭文化的使命。近些年，曾協(xié)助江蘇省伊斯蘭教協(xié)會成功舉辦了“江蘇省第一期中青年阿訇培訓(xùn)班”以及“伊斯蘭教傳人江蘇1350年歷史與發(fā)展研討會”。

改革開放以來，山巷清真寺每年都要接待大批來自海內(nèi)外的穆斯林，已成為鎮(zhèn)江市對外交往的重要窗口。一位曾僑居加拿大的巴基斯坦穆斯林已在鎮(zhèn)江工作了10年，鎮(zhèn)江成為了他的第二故鄉(xiāng)。一次，當(dāng)被問及是否習(xí)慣鎮(zhèn)江的生活時，他說：“知感真主！非常適應(yīng)。鎮(zhèn)江環(huán)境幽雅，人民安居樂業(yè)，信仰自由，這里沒有戰(zhàn)爭和恐怖，只有和平。”

近年來，在各級政府的關(guān)心、支持下，山巷清真寺的環(huán)境愈加幽雅，硬件不斷完善，先后被授予“鎮(zhèn)江市民族團(tuán)結(jié)進(jìn)步模范單位”、“全國模范清真寺”、“江蘇省模范清真寺”、“鎮(zhèn)江市先進(jìn)宗教活動場所”等光榮稱號。目前，山巷清真寺正計劃，在已完成的《中國少數(shù)民族古籍總目提要？江蘇回族卷》的基礎(chǔ)上，進(jìn)一步加大鎮(zhèn)江地區(qū)資料的搜集整理力度，努力挖掘伊斯蘭教歷史文化內(nèi)涵，建立“鎮(zhèn)江伊斯蘭教文博館”，通過一系列文章和實物向人們進(jìn)一步展示鎮(zhèn)江悠久燦爛的伊斯蘭文化。